RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PIM3Q86V86 326 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NXNL1Q96CM4 212 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 P2RY12Q9H244 342 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IL26Q9NPH9 171 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 COPG2Q9UBF2 871 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CD207Q9UJ71 328 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MED16Q9Y2X0 877 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MYLKQ15746 1914 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MYO7AQ13402 2215 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ANTXRLA6NF34 631 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 AGAP14A8MT82 685 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 A8MX80 341 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GPR39O43194 453 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DNAJC6O75061 913 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PRAMEF1O95521 474 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PRNPP04156 253 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 APOA4P06727 396 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CPA3P15088 417 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CD46P15529 392 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF30P17039 623 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ITGALP20701 1170 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 COL9A1P20849 921 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CD9P21926 228 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 VIPR1P32241 457 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GRIA2P42262 883 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IL12RB1P42701 662 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PTGER3P43115 390 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BST1Q10588 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RALGDSQ12967 914 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NFATC2Q13469 925 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ITIH4Q14624 930 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CHI3L2Q15782 390 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CHRNA6Q15825 494 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DPPA4Q7L190 304 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA21Q7Z572 469 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SNX20Q7Z614 316 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 STK40Q8N2I9 435 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC63Q8NA47 563 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GPR26Q8NDV2 337 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TMIEQ8NEW7 156 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RDH11Q8TC12 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 UCMAQ8WVF2 138 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MARVELD3Q96A59 401 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ARRDC3Q96B67 414 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BIRC8Q96P09 236 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FAM129BQ96TA1 746 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GPAMQ9HCL2 828 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MID2Q9UJV3 735 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 APPL1Q9UKG1 709 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SARDHQ9UL12 918 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms