RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 NR3C1P04150 777 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 IVLP07476 585 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ELFN1P0C7U0 828 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 KRT13P13646 458 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 OTX2P32243 289 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 POLD2P49005 469 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TDGF1P3P51864 188 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 RBPJQ06330 500 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PCOLCEQ15113 449 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TLR1Q15399 786 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 STILQ15468 1287 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CNGA2Q16280 664 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 KRT39Q6A163 491 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PHC2Q8IXK0 858 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PDILTQ8N807 584 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM174Q8WUU8 243 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 CLIC6Q96NY7 704 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 MED15Q96RN5 788 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 THAP9Q9H5L6 903 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 HCFC1P51610 2035 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 PCM1Q15154 2024 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf3-211ENST00000463372 FOXO6A8MYZ6 492 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TYRP1P17643 537 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 AMD1P17707 334 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 NELFEP18615 380 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ETFBP38117 255 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GSDMDP57764 484 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PPP2R2BQ00005 443 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GTF3C1Q12789 2109 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GPS2Q13227 327 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CES4AQ5XG92 561 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PELI3Q8N2H9 469 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KLHL6Q8WZ60 621 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 NR4A3Q92570 626 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GBP5Q96PP8 586 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TEX101Q9BY14 249 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GPAMQ9HCL2 828 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 RAB20Q9NX57 234 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 EDARQ9UNE0 448 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LILRA5A6NI73 299 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PEX12O00623 359 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SCRG1O75711 98 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PIGNO95427 931 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 EML2O95834 649 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PAEPP09466 180 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SLC2A4P14672 509 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DNASE1P24855 282 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CUL2Q13617 745 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LRP8Q14114 963 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ACOX1Q15067 660 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DOK6Q6PKX4 331 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MRGPREQ86SM8 312 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DRC7Q8IY82 874 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 AVL9Q8NBF6 648 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SNX10Q9Y5X0 201 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MAPK13O15264 365 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SRGAP2O75044 1071 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 UBXN7O94888 489 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZWINTO95229 277 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LY6G6DO95868 133 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ACVRL1P37023 503 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CDK3Q00526 305 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ACY1Q03154 408 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 IYDQ6PHW0 289 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LIPIQ6XZB0 460 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 UNC13DQ70J99 1090 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB106AQ8N104 65 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms