RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 MAP10Q9P2G4 905 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 VWA8A3KMH1 1905 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NDUFS3O75489 264 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CAPN3P20807 821 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SLC6A4P31645 630 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 RGRP47804 291 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 GNA12Q03113 381 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CLCQ05315 142 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ABI1Q8IZP0 508 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 FAM110BQ8TC76 370 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SLC29A1Q99808 456 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NACA2Q9H009 215 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 POLG2Q9UHN1 485 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TIMM22Q9Y584 194 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SQORQ9Y6N5 450 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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ACTB-207ENST00000462494 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 RING1Q06587 406 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 RAD51Q06609 339 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 OR2T3Q8NH03 318 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 KIAA1191Q96A73 305 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TRIB3Q96RU7 358 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.293e-14■■■□□ 15
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ACTB-207ENST00000462494 AURKCQ9UQB9 309 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CDC7O00311 574 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ECI2O75521 394 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CKMT2P17540 419 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 CHRM3P20309 590 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
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ACTB-207ENST00000462494 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZNF597Q96LX8 424 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZIC5Q96T25 663 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 GPR21Q99679 349 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 GALPQ9UBC7 116 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SEPT3Q9UH03 358 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 A0A1B0GTW7 788 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 VILLO15195 856 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 LCP2Q13094 533 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 LSAMPQ13449 338 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 MDGA1Q8NFP4 955 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ZNF599Q96NL3 588 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 MGME1Q9BQP7 344 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 BTN3A1O00481 513 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 VNN2O95498 520 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SLC10A3P09131 477 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 AGTR2P50052 363 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ACLYP53396 1101 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 DIO3P55073 304 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 OXCT1P55809 520 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 FAM189BP81408 668 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 PTPRNQ16849 979 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 ANKS6Q68DC2 871 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-207ENST00000462494 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.85■□□□□ 0.29
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