RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM202A6NGA9 273 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GCATO75600 419 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GIMD1P0DJR0 217 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 DHRS13Q6UX07 377 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 IPMKQ8NFU5 416 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TRIM58Q8NG06 486 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SCAMP4Q969E2 229 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 LGR4Q9BXB1 951 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GBA3Q9H227 469 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TRABDQ9H4I3 376 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FGF22Q9HCT0 170 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 HACD3Q9P035 362 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 DKK4Q9UBT3 224 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF711Q9Y462 761 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PRSS38A1L453 326 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 YY2O15391 372 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PRB1P04280 392 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PIRTP0C851 137 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 HLA-DPA1P20036 260 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CAMK2BQ13554 666 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PEX6Q13608 980 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 NR0B2Q15466 257 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CDKN3Q16667 212 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 KDELC1Q6UW63 502 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PELI3Q8N2H9 469 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PDXPQ96GD0 296 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 HIC2Q96JB3 615 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SPATA13Q96N96 652 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CARD9Q9H257 536 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 KNTC1P50748 2209 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 C5orf60A6NFR6 353 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 F5H423 210 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SLC4A1P02730 911 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FGF1P05230 155 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CEACAM5P06731 702 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GP1BAP07359 652 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 JUPP14923 745 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CLDN6P56747 220 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SLC1A5Q15758 541 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 DOK6Q6PKX4 331 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 BOCQ9BWV1 1114 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CLPBQ9H078 707 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ABCG4Q9H172 646 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GPR34Q9UPC5 381 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CPED1A4D0V7 1026 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 INPP4BO15327 924 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ASMTLO95671 621 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 IVLP07476 585 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PSMB4P28070 264 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 GNPDA1P46926 289 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 DCDC1P59894 354 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ARL10Q8N8L6 244 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 NAT6Q93015 286 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-213ENST00000460211 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms