RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 STC1P52823 247 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TPM4P67936 248 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PTSQ03393 145 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 GBE1Q04446 702 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 NR1D2Q14995 579 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PYCR3Q53H96 274 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 MAML1Q92585 1016 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 EXTL1Q92935 676 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SGF29Q96ES7 293 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC74BQ96LY2 380 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CDH19Q9H159 772 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPT10Q9P0V9 454 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 MATN3O15232 486 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN7O95471 211 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ASMTLO95671 621 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PRLP01236 227 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 GYPCP04921 128 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DQB2P05538 268 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF30P17039 623 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 WT1P19544 449 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CES1P23141 567 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CSF2RBP32927 897 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TAS2R40P59535 323 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00303Q3SY05 128 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF765Q7L2R6 523 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNT13Q8IUC8 556 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 NRSN1Q8IZ57 195 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PQLC3Q8N755 202 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 EXD3Q8N9H8 876 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 FATE1Q969F0 183 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PMEPA1Q969W9 287 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TSGA13Q96PP4 275 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF670Q9BS34 389 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNKQ9P0W0 207 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 NENFQ9UMX5 172 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 MAST4O15021 2626 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC28A2O43868 658 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 EML2O95834 649 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 JCHAINP01591 159 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PYGLP06737 847 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CA4P22748 312 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNCP24863 283 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CD82P27701 267 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CASP14P31944 242 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 LIMK2P53671 638 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL26P61254 145 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4F2P78329 520 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX6Q13608 980 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PDK2Q15119 407 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP8Q86W28 1048 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 DTX1Q86Y01 620 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNYQ8ND76 341 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 AGBL5Q8NDL9 886 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4D9Q8NGE8 314 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 EXD1Q8NHP7 514 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 RAPGEF5Q92565 580 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 FAF2Q96CS3 445 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCDQ96DY2 449 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 COX14Q96I36 57 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 TAAR9Q96RI9 348 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A3Q99624 504 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-206ENST00000446904 PACSIN1Q9BY11 444 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms