RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN11A1L157 253 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 B4DGG1 531 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PCCBP05166 539 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ITIH1P19827 911 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 IL4RP24394 825 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA4P29622 427 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SLC1A1P43005 524 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MMP13P45452 471 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CCR10P46092 362 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 RENBPP51606 427 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 BCL2L1Q07817 233 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 VASH2Q86V25 355 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SLC35F6Q8N357 371 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CCNYQ8ND76 341 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TAAR9Q96RI9 348 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 CDH19Q9H159 772 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 WDR26Q9H7D7 661 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 OR1A2Q9Y585 309 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 LRP4O75096 1905 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 APOL1O14791 398 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAFKO60675 156 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PRKCGP05129 697 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ELFN1P0C7U0 828 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ITIH2P19823 946 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 GPR3P46089 330 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RAB15P59190 212 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAXP61244 160 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GBE1Q04446 702 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-210ENST00000442481 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TCEAL1Q15170 157 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 LLGL1Q15334 1064 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TCEA2Q15560 299 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MARC1Q5VT66 337 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KAZNQ674X7 775 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DAAM2Q86T65 1068 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PQLC3Q8N755 202 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 FAM71BQ8TC56 605 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PDXPQ96GD0 296 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF599Q96NL3 588 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 NT5MQ9NPB1 228 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PQ67 120 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C9orf172C9J069 976 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AP1S1P61966 158 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GALNT2Q10471 571 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-210ENST00000442481 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LRRC38Q5VT99 294 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TRIM58Q8NG06 486 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZNF592Q92610 1267 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FAF2Q96CS3 445 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RNF157Q96PX1 679 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PSKH2Q96QS6 385 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DDA1Q9BW61 102 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZMYND15Q9H091 742 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
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