RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCD5Q86SK9 330 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTD1Q8N815 330 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPATCH11Q8N954 259 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NETO2Q8NC67 525 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 STYXQ8WUJ0 223 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCEAL3Q969E4 200 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LOXL4Q96JB6 756 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FEM1CQ96JP0 617 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGAP2Q99490 1192 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DRC3Q9H069 523 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEH1Q9H213 219 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMUR1Q9HB89 426 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NT5MQ9NPB1 228 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TREX1Q9NSU2 369 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 OSER1Q9NX31 292 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL37Q9NZH6 218 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL4A2P08572 1712 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITPR1Q14643 2758 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC189A1A4V9 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTMR11A4FU01 709 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C4orf47A7E2U8 309 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 G3V2L1 256 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLR5O60602 858 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 XYLBO75191 536 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM24O75264 130 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMG1O95456 288 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAMBPO95630 424 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPOP01588 193 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV3-27P01718 113 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU2F2P09086 479 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4Q2P0C623 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 THRAP10827 490 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TPH1P17752 444 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1P1-201ENST00000437111 CD86P42081 329 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1P1-201ENST00000437111 IDH3AP50213 366 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARPP19P56211 112 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJB13P59910 316 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CREMQ03060 361 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC34A1Q06495 639 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 OLIG2Q13516 323 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERC3Q15034 1050 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCN1Q15293 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAF12Q16514 161 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDR2Q16832 855 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTP2Q5QGT7 225 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEPROQ6NW34 567 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPGNQ6UW88 154 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RANBP10Q6VN20 620 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RINLQ6ZS11 566 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZS52 159 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHST9Q7L1S5 443 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC7BQ86TV6 843 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDZD3Q86UT5 571 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KBTBD6Q86V97 674 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIB1Q86YT6 1006 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX26Q8N6G2 289 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMCESQ96FZ2 354 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNDP1Q96KN2 507 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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