RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ING3Q9NXR8 418 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GCNT4Q9P109 453 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CPQQ9Y646 472 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PLXNA2O75051 1894 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SDK2Q58EX2 2172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PQF6 199 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 WASH3PC4AMC7 463 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 J3KRW8 73 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LAD1O00515 517 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM24O15164 1050 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KLK10O43240 276 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TULP3O75386 442 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CDKL5O76039 1030 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NOL4O94818 638 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ITGA5P08648 1049 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 IRF1P10914 325 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PROZP22891 400 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ANXA13P27216 316 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RPA1P27694 616 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PSMA5P28066 241 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LIG4P49917 911 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 COPAP53621 1224 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 UCNP55089 124 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 WNT3P56703 355 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MYL7Q01449 175 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NRN1LQ496H8 165 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MIIPQ5JXC2 388 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 AGBL4Q5VU57 503 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA1Q5VX52 437 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RINLQ6ZS11 566 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TERB1Q8NA31 727 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RSC1A1Q92681 617 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 WBP1Q96G27 269 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEH1Q9H213 219 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GPR35Q9HC97 309 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DPP3Q9NY33 737 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 JKAMPQ9P055 326 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ANKMY1Q9P2S6 941 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 UNC13CQ8NB66 2214 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 A0A087WWL8 130 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KPNA7A9QM74 516 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MYO1CO00159 1063 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 OGTO15294 1046 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 HUS1O60921 280 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TOX4O94842 621 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CD1AP06126 327 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GP1BBP13224 206 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 COMTP21964 271 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PCSK1P29120 753 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 OXTRP30559 389 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TPMTP51580 245 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 C21orf59P57076 290 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 BPIFB4P59827 614 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZXDBP98169 803 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FHL2Q14192 279 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PDIA5Q14554 519 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB6Q15916 424 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KYAT1Q16773 422 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC142Q17RM4 750 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms