RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 LARGE1O95461 756 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 POP4O95707 220 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 NGFP01138 241 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L2P0CJ85 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L3P0CJ86 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L5P0CJ88 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L6P0CJ89 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L7P0CJ90 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOP1P11387 765 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF23P17027 643 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD22P20273 847 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 WARSP23381 471 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 JAK1P23458 1154 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 HTR1FP30939 366 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 HTR7P34969 479 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPRD1P41143 372 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPRL1P41146 370 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC11A2P49281 568 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUOXP51687 545 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLCNKBP51801 687 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX17P56962 302 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC37A1P57057 533 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ROR1Q01973 937 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHAGQ02094 409 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM27E3Q08E93 113 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF234Q14588 700 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTF1Q14872 753 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPNMBQ14956 572 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF74Q16587 644 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF544Q6NX49 715 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSM6Q6P461 480 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISCA2Q86U28 154 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRSK2Q8IWQ3 736 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPC2Q8N158 579 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF525Q8N782 197 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01555Q8NAE3 123 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP19Q8WTR2 217 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATF6BQ99941 703 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD5Q9BSY4 110 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB126Q9BYW3 111 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 VEZTQ9HBM0 779 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPHK2Q9NRA0 654 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUX4Q9UBX2 424 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFDN2Q9UHV9 154 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIPK3Q9Y572 518 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMCHD1A6NHR9 2005 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLNCQ14315 2725 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLT1P17948 1338 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 B9A039 149 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM157AC9JC47 383 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 E9PAM4 449 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7ENM7 598 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNHIT1O43257 154 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZIC3O60481 467 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL18RAPO95256 599 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 THP07101 528 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RETP07949 1114 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM200BP0CF97 657 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GP1BBP13224 206 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSF2RAP15509 400 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSH3P20585 1137 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKACGP22612 351 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKCHP24723 683 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX2P32856 288 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTNR1BP49286 362 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KHKP50053 298 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERFP50548 548 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP2J2P51589 502 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IST1P53990 364 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNB2P62879 340 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF543Q08ER8 600 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL10RAQ13651 578 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACOX1Q15067 660 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFBP7Q16270 282 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 INSCQ1MX18 579 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYLK3Q32MK0 819 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTERF2Q49AM1 385 aa-1.04□□□□□ -2.58
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