RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FIBINQ8TAL6 211 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACDQ96AP0 544 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TLR9Q9NR96 1032 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IRAK3Q9Y616 596 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LTBP2Q14767 1821 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MT66 165 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN14A8MX76 684 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 E9PBE3 544 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR39O43194 453 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1I1O60431 355 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL41O60662 606 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT34O76011 436 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOP08100 348 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EPCAMP16422 314 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EPHA3P29320 983 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MNAT1P51948 309 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MXRA7P84157 204 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMG2Q02383 582 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL2L1Q07817 233 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ASPHQ12797 758 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAA1Q13131 559 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACAP2Q15057 778 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ISCA2Q86U28 154 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LSMEM2Q8N112 164 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RIN3Q8TB24 985 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MIPEPQ99797 713 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NUF2Q9BZD4 464 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TDP1Q9NUW8 608 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GTSE1Q9NYZ3 720 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PKP3Q9Y446 797 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.97□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01553A4QN01 128 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM233B4DJY2 109 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MATN2O00339 956 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GRM6O15303 877 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HDAC3O15379 428 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GSC2O15499 205 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FZD6O60353 706 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SUPT7LO94864 414 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF15O94989 841 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PGLSO95336 258 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN8P19075 237 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FDXRP22570 491 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-FP30511 346 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1S1P61966 158 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PFKPQ01813 784 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX6Q13608 980 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MPP7Q5T2T1 576 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NXNQ6DKJ4 435 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EPGNQ6UW88 154 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.96□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX9Q8N6V9 391 aa3.96□□□□□ -1.77
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