RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 NADSYN1Q6IA69 706 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 BORAQ6PGQ7 559 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 AQP12AQ8IXF9 295 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TUBGCP3Q96CW5 907 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SLC29A1Q99808 456 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CIB1Q99828 191 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 RNF112Q9ULX5 631 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP10A1A4S6 786 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC160A6NGH7 325 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT3HB4E1H0 165 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT3HO75486 399 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 HSD17B1P14061 328 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CLCQ05315 142 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 BNIP2Q12982 314 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 LCP2Q13094 533 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 VPS26BQ4G0F5 336 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ERMP1Q7Z2K6 904 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO39Q8N4B4 442 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CANT1Q8WVQ1 401 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 DTNBP1Q96EV8 351 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MYEOVQ96EZ4 313 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TRIB3Q96RU7 358 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TUBB1Q9H4B7 451 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 GIMAP2Q9UG22 337 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 OR6C75A6NL08 312 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TIPRLO75663 272 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CAPN3P20807 821 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 RPS6KA3P51812 740 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 RPS6KA2Q15349 733 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 COQ5Q5HYK3 327 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ZFP28Q8NHY6 868 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM79Q9BSE2 394 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC68Q9H2F9 335 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 IL1RL2Q9HB29 575 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 POLG2Q9UHN1 485 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 HGFP14210 728 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 IDO1P14902 403 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 NAA20P61599 178 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 RAD51Q06609 339 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 GPR162Q16538 588 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SPATS1Q496A3 300 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PPP4R4Q6NUP7 873 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 GOLM1Q8NBJ4 401 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 LRCH3Q96II8 777 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 KCNA7Q96RP8 456 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TCF12Q99081 682 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MGME1Q9BQP7 344 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 THEGQ9P2T0 379 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 LCHNA4D1U4 455 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 F5H5T6 163 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 AKAP10O43572 662 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SOAT2O75908 522 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 FOXM1Q08050 763 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CRHR2Q13324 411 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 INPP5AQ14642 412 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ANKS6Q68DC2 871 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PAQR3Q6TCH7 311 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SLC15A3Q8IY34 581 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 LGI2Q8N0V4 545 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TSPAN14Q8NG11 270 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 COMMD8Q9NX08 183 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00032P0C843 101 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM32Q13049 653 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CYTH1Q15438 398 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MYO1HQ8N1T3 1032 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 TSPEARQ8WU66 669 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 MAGEH1Q9H213 219 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PNPLA3Q9NST1 481 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT3Q9UH03 358 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 GABRQQ9UN88 632 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SYCE1LA8MT33 242 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 CRCPO75575 148 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 H6PDO95479 791 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 FMO4P31512 558 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PRKCQQ04759 706 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA19Q7Z5L4 167 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PACRGLQ8N7B6 248 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA17Q96L03 361 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS56P0CW18 603 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 ARPP19P56211 112 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 FAM189BP81408 668 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf22Q49AR2 442 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 KRT80Q6KB66 452 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD13-201ENST00000392539 OGFOD2Q6N063 350 aa26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms