RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RPTORQ8N122 1335 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LIASO43766 372 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RLN1P04808 185 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 UGT2B4P06133 528 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CD2P06729 351 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SSTP61278 116 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HLFQ16534 295 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MOGQ16653 247 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ASB7Q9H672 318 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SREBF1P36956 1147 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM76BQ5HYJ3 339 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HALP42357 657 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM15Q13444 863 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT12Q8IV01 421 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL6Q8N841 843 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MARK1Q9P0L2 795 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEA3O75764 348 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA5P08758 320 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CA9Q16790 459 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 EIPR1Q53HC9 387 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C16orf46Q6P387 395 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SPESP1Q6UW49 350 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LDHDQ86WU2 507 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 UFD1Q92890 307 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEAL4Q96EI5 215 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF639Q9UID6 485 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COL15A1P39059 1388 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GAKO14976 1311 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SPTLC1O15269 473 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 AGTR1P30556 359 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RBBP4Q09028 425 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ABRQ12979 859 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GK3PQ14409 553 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MED22Q15528 200 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ELMOD2Q8IZ81 293 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CATP04040 527 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHA3P29320 983 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF234Q14588 700 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZPBP2Q6X784 338 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF567Q8N184 647 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CERS2Q96G23 380 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE10AQ9Y233 779 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJB6O75190 326 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 STAG3L1P0CL83 205 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFBP5P24593 272 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MGAT1P26572 445 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ELMO1Q92556 727 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNA1CQ13936 2221 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 H0Y858 1186 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PRRG1O14668 218 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 EML3Q32P44 896 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMK1GQ96NX5 476 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM168Q9H0V1 697 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 I3L521 148 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEF1O95521 474 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HTR2AP28223 471 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXD12P35452 270 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 OGFOD2Q6N063 350 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 STRADAQ7RTN6 431 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NPAS2Q99743 824 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFP57Q9NU63 452 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms