RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.6■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 GPR22Q99680 433 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 CDH19Q9H159 772 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM165Q9HC07 324 aa18.6■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 DCXO43602 365 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 LATS1O95835 1130 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 COPG2Q9UBF2 871 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 SEPT3Q9UH03 358 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 SYN1P17600 705 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 TTKP33981 857 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 ESRRGP62508 458 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 CDKL1Q00532 357 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF358Q9NW07 568 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 CPQQ9Y646 472 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 CXCL14O95715 111 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC1A2P43004 574 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 CYP4F8P98187 520 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 CTBP1Q13363 440 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.569e-8■■■■□ 25.5
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SPNS1-204ENST00000352260 CLEC14AQ86T13 490 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 TMC8Q8IU68 726 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 DSELQ8IZU8 1212 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 HDCP19113 662 aa18.57■□□□□ 0.56
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SPNS1-204ENST00000352260 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 PKP2Q99959 881 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC3Q9BY71 257 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 MROH6A6NGR9 719 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 GFRA2O00451 464 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 TBL1XO60907 577 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINB7O75635 380 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-204ENST00000352260 LRG1P02750 347 aa18.57■□□□□ 0.56
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