RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 KYNUQ16719 465 aa27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 CEP68Q76N32 757 aa27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 SGSM3Q96HU1 749 aa27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 NINJ2Q9NZG7 142 aa27.64■■■□□ 2.02
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC162PA2VCL2 907 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ERLIN1O75477 346 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GOT2P00505 430 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ITGALP20701 1170 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SSTR1P30872 391 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 IRF4Q15306 451 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PMS2CLQ68D20 193 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 RAET1GQ6H3X3 334 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CAPN12Q6ZSI9 719 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 OR4L1Q8NH43 312 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 TXLNGYQ9BZA5 131 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 VPS37BQ9H9H4 285 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PLAC1Q9HBJ0 212 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PCCBP05166 539 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CD27P26842 260 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PHBP35232 272 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GPR1P46091 355 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 BRD3Q15059 726 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CHRNA6Q15825 494 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SNX20Q7Z614 316 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA7Q8IZY2 2146 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CERS2Q96G23 380 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA4AQ9H3S1 761 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 EBF2Q9HAK2 575 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FZD3Q9NPG1 666 aa27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 THADAQ6YHU6 1953 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FPGTO14772 594 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 LILRB5O75023 590 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ARNTP27540 789 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GPX6P59796 221 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CACNG1Q06432 222 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 NFATC2Q13469 925 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 GPR33Q49SQ1 333 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PNCKQ6P2M8 343 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 KCNMB4Q86W47 210 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF398Q8TD17 642 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CAVIN3Q969G5 261 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ASB8Q9H765 288 aa27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC151A5D8V7 595 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 DLL1O00548 723 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 RAD51BO15315 384 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 RHOBTB1O94844 696 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 TEAD1P28347 426 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PLK5Q496M5 336 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CYS1Q717R9 158 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CALML6Q8TD86 181 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SERAC1Q96JX3 654 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 MYOCQ99972 504 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa27.61■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 OR51F1A6NGY5 319 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 STX2P32856 288 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 LMNTD2Q8IXW0 634 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 AGAP2Q99490 1192 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CATSPERZQ9NTU4 200 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 MOCS1Q9NZB8 636 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ACSL3O95573 720 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FOXN2P32314 431 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 IGFALSP35858 605 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 NEPROQ6NW34 567 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF449Q6P9G9 518 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM145Q8NBT3 493 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G15Q8NCC3 412 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 ULK4Q96C45 1275 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 VPS35Q96QK1 796 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FAM167BQ9BTA0 163 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SMOXQ9NWM0 555 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CRLS1Q9UJA2 301 aa27.6■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa27.59■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 FADS2P1A8MWK0 482 aa27.59■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 K7ESM1 405 aa27.59■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SOD1P00441 154 aa27.59■■■□□ 2.01
GIPC1-201ENST00000345425 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms