RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342833.3

FOXD4L3-201, Transcript of forkhead box D4 like 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD4L3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3-201ENST00000342833 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 A0A0J9YYE9 177 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SUPT7LO94864 414 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TRBC1P01850 177 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PRDX6P30041 224 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RAP1GDS1P52306 607 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RAD51Q06609 339 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 FAR2Q96K12 515 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 MOSPD3O75425 235 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 VPS26AO75436 327 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TM7SF2O76062 418 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RHOP08100 348 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SRCP12931 536 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CACNG1Q06432 222 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 NXNQ6DKJ4 435 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TMEM25Q86YD3 366 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KIAA1191Q96A73 305 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 FAM161BQ96MY7 647 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TDP1Q9NUW8 608 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 UBXN8O00124 270 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 GPR39O43194 453 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KRT34O76011 436 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 BMP1P13497 986 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 MTHFD2P13995 350 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CD9P21926 228 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SERPINA4P29622 427 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PTGER3P43115 390 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ATP6V0D1P61421 351 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 THTPAQ9BU02 230 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ALPK3Q96L96 1907 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 LAMA3Q16787 3333 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KERAO60938 352 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 NIPSNAP2O75323 286 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 COX4I1P13073 169 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SLC25A3Q00325 362 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 FUT11Q495W5 492 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 UNC50Q53HI1 259 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 STK40Q8N2I9 435 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 HERVK_113Q902F9 699 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KCNJ9Q92806 393 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 GALPQ9UBC7 116 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SDHDO14521 159 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ESR1P03372 595 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SATB1Q01826 763 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 UBE3AQ05086 875 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 PFKFB4Q16877 469 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 SLC30A3Q99726 388 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RNF112Q9ULX5 631 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.58■□□□□ 0.89
FOXD4L3-201ENST00000342833 LINC01553A4QN01 128 aa20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L3-201ENST00000342833 CAPN8A6NHC0 703 aa20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L3-201ENST00000342833 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L3-201ENST00000342833 SLC22A2O15244 555 aa20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L3-201ENST00000342833 HOXA9P31269 272 aa20.58■□□□□ 0.88
FOXD4L3-201ENST00000342833 IRS1P35568 1242 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms