RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CAPN8A6NHC0 703 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 NIPSNAP2O75323 286 aa17.8■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SUV39H2Q9H5I1 410 aa17.8■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 SAMD11Q96NU1 681 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa17.8■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 MARK1Q9P0L2 795 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 IKZF3Q9UKT9 509 aa17.8■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 ZMYM5Q9UJ78 669 aa17.79■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 CHD9Q3L8U1 2897 aa17.79■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 A8MUI8 341 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 F8W8V4 182 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 SEL1L3Q68CR1 1132 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 NAT14Q8WUY8 206 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 OR52B2Q96RD2 323 aa17.78■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 P2RY12Q9H244 342 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 IL26Q9NPH9 171 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 IQCF5A8MTL0 148 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TMEM233B4DJY2 109 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 UBXN8O00124 270 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 HDAC3O15379 428 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 VPS26AO75436 327 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF1O95521 474 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CYP17A1P05093 508 aa17.78■□□□□ 0.44
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