RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 STK39Q9UEW8 545 aa21.65■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 VPS26AO75436 327 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 PPM1AP35813 382 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 AP1S1P61966 158 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 CREMQ03060 361 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 BHMTQ93088 406 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 CDRT15Q96T59 188 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 PKP3Q9Y446 797 aa21.64■■□□□ 1.06
SPHK1-201ENST00000323374 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 SUPT3HO75486 399 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CD9P21926 228 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GABRR2P28476 465 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CLCN4P51793 760 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 SH3BP2P78314 561 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PTPRRQ15256 657 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MAPRE2Q15555 327 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 RETSATQ6NUM9 610 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GPR65Q8IYL9 337 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 DDI1Q8WTU0 396 aa21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 SYCE1LA8MT33 242 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 LILRB3O75022 631 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CDK14O94921 469 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MT-CO1P00395 513 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 FGF4P08620 206 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CA8P35219 290 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CYP4F8P98187 520 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 C19orf60Q96EN9 201 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 YME1L1Q96TA2 773 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 WDR41Q9HAD4 459 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEE1Q9HCI5 957 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF711Q9Y462 761 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 LTBP2Q14767 1821 aa21.63■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 OR1I1O60431 355 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 EFCAB14O75071 495 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GK5Q6ZS86 529 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 HIPK4Q8NE63 616 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 IL17CQ9P0M4 197 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CFLARO15519 480 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CKMP06732 381 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CSF2RAP15509 400 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PTGER3P43115 390 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 STX5Q13190 355 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.054e-8■□□□□ 9.1
SPHK1-201ENST00000323374 GAREM2Q75VX8 874 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 APCDD1Q8J025 514 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 MYO19Q96H55 970 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 NPAS2Q99743 824 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GALPQ9UBC7 116 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.62■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 K7ERQ8 282 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 TGM5O43548 720 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ECI2O75521 394 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PGLSO95336 258 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ARSAP15289 507 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 HMGCLP35914 325 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 GEN1Q17RS7 908 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 PIGGQ5H8A4 983 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 HTR3DQ70Z44 454 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 STK40Q8N2I9 435 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 KCNJ9Q92806 393 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 ACDQ96AP0 544 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0U1RQS6 177 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 CDC7O00311 574 aa21.61■■□□□ 1.05
SPHK1-201ENST00000323374 AZIN1O14977 448 aa21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms