RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 NCS1P62166 190 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PSMD5Q16401 504 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 AMBNQ9NP70 447 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 HSPB11Q9Y547 144 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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PACS1-201ENST00000320580 SLC2A4P14672 509 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NFKB1P19838 968 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 Q3C1V9 767 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZNF280DQ6N043 979 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RNF139Q8WU17 664 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZNF778Q96MU6 729 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CES1P23141 567 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CCNA1P78396 465 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ELMOD1Q8N336 334 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 OR2T12Q8NG77 320 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZNF222Q9UK12 451 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.57■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 KMOO15229 486 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SCN1BQ07699 218 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 OXA1LQ15070 435 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TAF12Q16514 161 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RABL3Q5HYI8 236 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MYDGFQ969H8 173 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 AKT1S1Q96B36 256 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NDUFS3O75489 264 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 IL18RAPO95256 599 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 STXBP2Q15833 593 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 IL31RAQ8NI17 732 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DSN1Q9H410 356 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 H0YC42 278 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A3O75751 556 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MAP2K4P45985 399 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ALDH3A2P51648 485 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ARHGEF6Q15052 776 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 COPS4Q9BT78 406 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MUC13Q9H3R2 512 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ING4Q9UNL4 249 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PLOD3O60568 738 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CD4P01730 458 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 GRM1Q13255 1194 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CYP20A1Q6UW02 462 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 LRRC58Q96CX6 371 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RANBP9Q96S59 729 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DPY30Q9C005 99 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RGS18Q9NS28 235 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DDIT4Q9NX09 232 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SNX7Q9UNH6 387 aa16.56■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 VNN1O95497 513 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CHRNA1P02708 482 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 BLVRAP53004 296 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PGGT1BP53609 377 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 GEMP55040 296 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CCDC185Q8N715 623 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 LGALS12Q96DT0 336 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 IDI2Q9BXS1 227 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 KLQ9UEF7 1012 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PRG6 482 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SULT1C4O75897 302 aa16.55■□□□□ 0.24
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