RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 OPRD1P41143 372 aa16.27■□□□□ 0.2
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CHTF18-202ENST00000317063 PDE1BQ01064 536 aa16.27■□□□□ 0.2
CHTF18-202ENST00000317063 CAMK2BQ13554 666 aa16.27■□□□□ 0.2
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CHTF18-202ENST00000317063 GSTT2BP0CG30 244 aa16.26■□□□□ 0.19
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CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.26■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.26■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.26■□□□□ 0.19
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CHTF18-202ENST00000317063 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 PAMP19021 973 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 SERPINA4P29622 427 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 IRX4P78413 519 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 HPCAP84074 193 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF460Q14592 562 aa16.25■□□□□ 0.19
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CHTF18-202ENST00000317063 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.25■□□□□ 0.19
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CHTF18-202ENST00000317063 BANPQ8N9N5 519 aa16.25■□□□□ 0.19
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CHTF18-202ENST00000317063 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 BRD9Q9H8M2 597 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF358Q9NW07 568 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CD207Q9UJ71 328 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 HCN2Q9UL51 889 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CRTAMO95727 393 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CPA6Q8N4T0 437 aa16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CHTF18-202ENST00000317063 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.25■□□□□ 0.19
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