RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 TBCELQ5QJ74 424 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RNF112Q9ULX5 631 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 V9GYQ6 96 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 MT-ND1P03886 318 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 KRT80Q6KB66 452 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TRIML2Q8N7C3 387 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 OR4K2Q8NGD2 314 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NUDT8Q8WV74 236 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ACOX2Q99424 681 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ETAA1Q9NY74 926 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CRCPO75575 148 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CLCQ05315 142 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CRHR2Q13324 411 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 MAP7Q14244 749 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RABL3Q5HYI8 236 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CBR4Q8N4T8 237 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RMDN1Q96DB5 314 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf50Q9BV19 199 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 OLAHQ9NV23 265 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 MED16Q9Y2X0 877 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FXYD1O00168 92 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CLIC3O95833 236 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PBX3P40426 434 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SCNN1BP51168 640 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CARM1Q86X55 608 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TOP1MTQ969P6 601 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SLAMF8Q9P0V8 285 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GPR39O43194 453 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ECI2O75521 394 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 OAZ2O95190 189 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NFKB2Q00653 900 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 KANK2Q63ZY3 851 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FAM47BQ8NA70 645 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 C8orf48Q96LL4 319 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GPR21Q99679 349 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ASB1Q9Y576 335 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 OR1I1O60431 355 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PRAMEF11O60813 436 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 BAIAP3O94812 1187 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 STAMBPO95630 424 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SLC5A2P31639 672 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ACADVLP49748 655 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 STC1P52823 247 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GALNT7Q86SF2 657 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 OSBPL11Q9BXB4 747 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PTTG2Q9NZH5 202 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NDUFAF1Q9Y375 327 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ASLP04424 464 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GATMP50440 423 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 LAMB3Q13751 1172 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 CEPT1Q9Y6K0 416 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ADAMTS4O75173 837 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FGF1P05230 155 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SLC6A2P23975 617 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SLC6A4P31645 630 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NR1H2P55055 460 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FEM1CQ96JP0 617 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM74Q96NL1 305 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 PLK2Q9NYY3 685 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 FNIP2Q9P278 1114 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 DRGXA6NNA5 263 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 LBPP18428 481 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 TACR2P21452 398 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ACVR1Q04771 509 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 EPHX4Q8IUS5 362 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ROPN1LQ96C74 230 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 LRRC58Q96CX6 371 aa25.21■■□□□ 1.63
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