RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 IRAK3Q9Y616 596 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 RFXAPO00287 272 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 SUPT7LO94864 414 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 CCR2P41597 374 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 SGSHP51688 502 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.45■□□□□ 0.87
KCNS3-201ENST00000304101 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 EPOPA6NHQ4 379 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CBX4O00257 560 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 HERVK_113P63132 956 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 IRGCQ6NXR0 463 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CHSY3Q70JA7 882 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TMC8Q8IU68 726 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 HIPK4Q8NE63 616 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 VPS28Q9UK41 221 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.45■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CES1P23141 567 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 INHBCP55103 352 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ART3Q13508 389 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ITIH5Q86UX2 942 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 GPR65Q8IYL9 337 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 NTHL1P78549 312 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 KBTBD6Q86V97 674 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CDRT15Q96T59 188 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 LRRC3Q9BY71 257 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 C2orf81A6NN90 581 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PRLP01236 227 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CYTH1Q15438 398 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 EXT2Q93063 718 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 MUC3BQ9H195 1237 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 WDR41Q9HAD4 459 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TSPAN3O60637 253 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PRSS56P0CW18 603 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 SQLEQ14534 574 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 UNC50Q53HI1 259 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PIGGQ5H8A4 983 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 MIEF2Q96C03 454 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ECSITQ9BQ95 431 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 UBDO15205 165 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 HDCP19113 662 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 THOP1P52888 689 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 BHMTQ93088 406 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ASB2Q96Q27 587 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TCF12Q99081 682 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CPQQ9Y646 472 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CFLARO15519 480 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 ERVK-21P61565 698 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 CDC16Q13042 620 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNS3-201ENST00000304101 OR4D1Q15615 310 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms