RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SLC7A5Q01650 507 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CAV1Q03135 178 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC38Q502W7 563 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM61Q5EBN2 209 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ALS2CLQ60I27 953 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 LAYNQ6UX15 382 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 KDM7AQ6ZMT4 941 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZSR6 202 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 OR13H1Q8NG92 308 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 RUBCNQ92622 972 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 AGAP2Q99490 1192 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 APOOQ9BUR5 198 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 WDR26Q9H7D7 661 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TREX1Q9NSU2 369 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 APPL1Q9UKG1 709 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SOX13Q9UN79 622 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GVT2 93 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEB16A2A368 324 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 AGAP14A8MT82 685 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 E7ESA3 106 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CFIP05156 583 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TGM1P22735 817 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CRADDP78560 199 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CDK3Q00526 305 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 BNC1Q01954 994 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PEX6Q13608 980 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 NFATC4Q14934 902 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CSRP2Q16527 193 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ASCL5Q7RTU5 278 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 HEATR4Q86WZ0 1026 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PDIK1LQ8N165 341 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 MPP5Q8N3R9 675 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 LRRN4CLQ8ND94 238 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ART4Q93070 314 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 COX14Q96I36 57 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF778Q96MU6 729 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 VPS35Q96QK1 796 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA16Q9BXB7 569 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CHRAC1Q9NRG0 131 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SMOXQ9NWM0 555 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ESYT3A0FGR9 886 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PRAMEF1O95521 474 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 KELP23276 732 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 HTR1BP28222 390 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CTSKP43235 329 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ARSDP51689 593 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 THOP1P52888 689 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ARL4CP56559 192 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 C21orf59P57076 290 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 IRX4P78413 519 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS15P98073 1019 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 GUCY2DQ02846 1103 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SPEM2Q0P670 501 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 GRIK2Q13002 908 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ITGA9Q13797 1035 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 PTK2BQ14289 1009 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TRADDQ15628 312 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNA6Q15825 494 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC6Q16204 474 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 HIF1AQ16665 826 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 KIF19Q2TAC6 998 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 MSS51Q4VC12 460 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TPRG1LQ5T0D9 272 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FNBP1LQ5T0N5 605 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FAM151BQ6UXP7 276 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 MACC1Q6ZN28 852 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM135Q86UB9 458 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC39Q96DD0 335 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SGSM3Q96HU1 749 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 TBATAQ96M53 351 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms