RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF778Q96MU6 729 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 FAM92AA1XBS5 289 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 H3BMM5 538 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 I6L893 689 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CCL22O00626 93 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 COQ9O75208 318 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 IPO13O94829 963 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 HEXDCQ8WVB3 486 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TMCO1Q9UM00 188 aa10.6□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ADAM12O43184 909 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 AKT1P31749 480 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT2P50583 147 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CLCN2P51788 898 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 GPR158Q5T848 1215 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 USP45Q70EL2 814 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 SKA1Q96BD8 255 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 DKK3Q9UBP4 350 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ARL5AQ9Y689 179 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CACNA1BQ00975 2339 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC162PA2VCL2 907 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 NPHS1O60500 1241 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TIMP1P01033 207 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CFIP05156 583 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CYP4F8P98187 520 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 HIPK4Q8NE63 616 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 SUSD6Q92537 303 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 PLK2Q9NYY3 685 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ADA2Q9NZK5 511 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TBX21Q9UL17 535 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 BTN3A1O00481 513 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 UBDO15205 165 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 MGRN1O60291 552 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 SLC26A3P40879 764 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 PGFP49763 221 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP8P85298 464 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF460Q14592 562 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CGB2Q6NT52 195 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 TTC23LQ6PF05 361 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF276Q8N554 614 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.59□□□□□ -0.71
PRRX1-201ENST00000239461 ITM2AO43736 263 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 WFS1O76024 890 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2ADP20671 130 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 MPSTP25325 297 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HMOX2P30519 316 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CSKP41240 450 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 SULT2A1Q06520 285 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CERS6Q6ZMG9 384 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H2AJQ99878 128 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 H2AFJQ9BTM1 129 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 HELZP42694 1942 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 C2orf78A6NCI8 922 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 ADRA1AP35348 466 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 KLC1Q07866 573 aa10.58□□□□□ -0.72
PRRX1-201ENST00000239461 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms