RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 BST1Q10588 318 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TRABD2AQ86V40 505 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MAGEH1Q9H213 219 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 E9PAM4 449 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 H3BNX3 289 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SSNA1O43805 119 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 IDSP22304 550 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 TEAD4Q15561 434 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MON1BQ7L1V2 547 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MCM8Q9UJA3 840 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SQORQ9Y6N5 450 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PTGES3LE9PB15 166 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CLDN9O95484 217 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TRBC1P01850 177 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 TACR2P21452 398 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 S100A1P23297 94 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CD52P31358 61 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KHKP50053 298 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CASP5P51878 434 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 TDRPQ86YL5 185 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 NDNQ99608 321 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ACBD6Q9BR61 282 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TMEM150BA6NC51 233 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AP5Z1O43299 807 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CBFA2T3O75081 653 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GJB6O95452 261 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AP2A1O95782 977 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DNAJB1P25685 340 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GNPDA1P46926 289 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RPS6KA3P51812 740 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TEX44Q53QW1 395 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DEF8Q6ZN54 512 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 SNX27Q96L92 541 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.19□□□□□ -1.26
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CPS1-201ENST00000233072 MIOSQ9NXC5 875 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PLLPQ9Y342 182 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TLL1O43897 1013 aa7.19□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TMCC2O75069 709 aa7.19□□□□□ -1.26
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