RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CDCA3-201ENST00000229265 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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CDCA3-201ENST00000229265 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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