RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 TRAF2Q12933 501 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BORCS5Q969J3 196 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 VPS50Q96JG6 964 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM74Q96NL1 305 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 HS3ST4Q9Y661 456 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BAIAP3O94812 1187 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 GSK3BP49841 420 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BNIP2Q12982 314 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TBPL2Q6SJ96 375 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TEX37Q96LM6 180 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ATP13A1Q9HD20 1204 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 AZIN1O14977 448 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PEX11BO96011 259 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ELK4P28324 431 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 AFMIDQ63HM1 303 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 HASPINQ8TF76 798 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ARMC7Q9H6L4 198 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 SLAMF8Q9P0V8 285 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 SLC7A4O43246 635 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 KPNA6O60684 536 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 MYL3P08590 195 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 CD1DP15813 335 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 MATN1P21941 496 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PTPRCAPQ14761 206 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 C16orf87Q6PH81 154 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 COX4I2Q96KJ9 171 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 DOK1Q99704 481 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ALG2Q9H553 416 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 POLG2Q9UHN1 485 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 RFC2P35250 354 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 MAGEA8P43361 318 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BRCC3P46736 316 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BEX3Q00994 111 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 NFYCQ13952 458 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 OR4D1Q15615 310 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PRMT9Q6P2P2 845 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF549Q6P9A3 640 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 TBATAQ96M53 351 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM149A-201ENST00000227065 BMXP51813 675 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 GRB14Q14449 540 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 FAM171BQ6P995 826 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 TLK2Q86UE8 772 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM125Q96AQ2 219 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 ARL5CA6NH57 179 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 DCDC5Q6ZRR9 648 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 PFDN4Q9NQP4 134 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 SELENONQ9NZV5 590 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 COQ6Q9Y2Z9 468 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 TIMM22Q9Y584 194 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 CORINQ9Y5Q5 1042 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 K7EPI3 171 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 MMP2P08253 660 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 INHBBP09529 407 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 OCM2P0CE71 109 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 NFKB2Q00653 900 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 DDHD1Q8NEL9 900 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 GID8Q9NWU2 228 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 MROH6A6NGR9 719 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 CBFA2T3O75081 653 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 FGF4P08620 206 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 RENBPP51606 427 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 GNA12Q03113 381 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 LIPEQ05469 1076 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 PAGE3Q5JUK9 113 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 SIRPB2Q5JXA9 342 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 ACDQ96AP0 544 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 HMCESQ96FZ2 354 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM149A-201ENST00000227065 SLC30A3Q99726 388 aa26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms