RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KCTD6Q8NC69 237 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 APPL2Q8NEU8 664 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PAFAH2Q99487 392 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1B0GVM2 712 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 GLOD5A6NK44 160 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 BECN2A8MW95 431 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 J3KR12 359 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 VWA5AO00534 786 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 VDRP11473 427 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RAD23BP54727 409 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNC3Q14003 757 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ETFDHQ16134 617 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 FSCBQ5H9T9 825 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM198Q66K66 360 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ADGRA1Q86SQ6 560 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PIM3Q86V86 326 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 DSELQ8IZU8 1212 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 AADATQ8N5Z0 425 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 AVL9Q8NBF6 648 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 GCNAQ96QF7 691 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ABHD1Q96SE0 405 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 POT1Q9NUX5 634 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 COPG2Q9UBF2 871 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR91A4D1P6 747 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 WNT9BO14905 357 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TIMM23O14925 209 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ASAP2O43150 1006 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 HSPA12AO43301 675 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ZIC3O60481 467 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 VNN2O95498 520 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 LCATP04180 440 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PTMSP20962 102 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 MCCP23508 829 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ACADLP28330 430 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PLCD1P51178 756 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PNLIPRP2P54317 469 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 GRIK2Q13002 908 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 TNFAIP1Q13829 316 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 HNF4GQ14541 408 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 LCE1DQ5T752 114 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 RADILQ96JH8 1075 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 EGLN2Q96KS0 407 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 SH3GL2Q99962 352 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KIFC3Q9BVG8 833 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 PIGMQ9H3S5 423 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCA2-241ENST00000635397 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.44□□□□□ -1.54
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