RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 GLIS1Q8NBF1 620 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 LHX3Q9UBR4 397 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SDC3O75056 442 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SPAG7O75391 227 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 WNT1P04628 370 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RIPK1Q13546 671 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MYLK3Q32MK0 819 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD7Q6UXD7 560 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RHOT1Q8IXI2 618 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KIRREL3Q8IZU9 778 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PGBD5Q8N414 524 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MIEF2Q96C03 454 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SEPT10Q9P0V9 454 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL14Q9P2G3 628 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 LGALS13Q9UHV8 139 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CHD5Q8TDI0 1954 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf96A6NNT2 1141 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PRAMEF11O60813 436 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TCEA3O75764 348 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ADH1BP00325 375 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXN2P32314 431 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNG2Q16589 344 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PARP15Q460N3 678 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ATPAF2Q8N5M1 289 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEB18Q96M61 343 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3GL3Q99963 347 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PDFQ9HBH1 243 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PSTPIP1O43586 416 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KDELR1P24390 212 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEA4P43358 317 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR45BQ5MNZ6 344 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA0895LQ68EN5 471 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NSMCE1Q8WV22 266 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SPOCK2Q92563 424 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXJ1Q92949 421 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC77Q9BR77 488 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NT5MQ9NPB1 228 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLON5A6NGN9 336 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC400499M0QZD8 3231 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD51BO15315 384 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP20O60882 483 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ADRB3P13945 408 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TAC1P20366 129 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 OXTRP30559 389 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 AIF1P55008 147 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FGL2Q14314 439 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 IHHQ14623 411 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 STAT4Q14765 748 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RFX6Q8HWS3 928 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB124Q8NES8 71 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PITPNM3Q9BZ71 974 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GAREM1Q9H706 876 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 EURLQ9NYK6 297 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC72A6NJI9 287 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MAFKO60675 156 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ANP32DO95626 131 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PRNPP04156 253 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINK2P20155 84 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ARSEP51690 589 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 LMNB2Q03252 620 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC3Q13217 504 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM46CQ5VWP2 391 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KATNAL2Q8IYT4 538 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PNPLA1Q8N8W4 532 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM1BQ8NB78 822 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2T34Q8NGX1 318 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf216Q8TAB5 229 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms