RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf81A6NN90 581 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRTAMO95727 393 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEAD1P28347 426 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA6P43360 314 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 THOP1P52888 689 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE1BQ01064 536 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-BQ31612 363 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MINDY1Q8N5J2 469 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR26Q9H7D7 661 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASS4Q9NQ75 786 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKP3Q9Y446 797 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1A2Q9Y585 309 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL5AQ9Y689 179 aa33■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPFIA2O75334 1257 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIA1P42261 906 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR1P46091 355 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBB2AQ13885 445 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTK2BQ14289 1009 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ11Q14654 390 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT12Q99456 494 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBB2BQ9BVA1 445 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAREM1Q9H706 876 aa32.99■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DFNA5O60443 496 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIP17213 487 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPH1P17752 444 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPOP22079 712 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF423Q2M1K9 1284 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXR1Q8N573 874 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR26Q8NDV2 337 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIFA1Q9NP55 256 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM9BQ9NQ34 198 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASIC3Q9UHC3 531 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYLKQ15746 1914 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP3B1O00203 1094 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDF9O60383 454 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOD1P00441 154 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR1BP28222 390 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAMLQ86YT9 394 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPT1BQ92523 772 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX101Q9BY14 249 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCY8P40145 1251 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU6F1Q14863 301 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFATC4Q14934 902 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPRG1LQ5T0D9 272 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MACC1Q6ZN28 852 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf43Q9BQ61 176 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRFAP1Q9Y605 127 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX7O15400 261 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDB2O43679 373 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 BUD23O43709 281 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TERF1P54274 439 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1024LP59773 190 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SARNPP82979 210 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf54Q08AI8 447 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 FZD2Q14332 565 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALS2CLQ60I27 953 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARGQ86W56 976 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEATR4Q86WZ0 1026 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2I1PQ8NGU4 316 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP2Q99490 1192 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH14Q0VDD8 3507 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa32.95■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTI1O43156 1089 aa32.95■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK3Q00526 305 aa32.95■■■□□ 2.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAM1P38567 509 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC8BQ6P9F7 803 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAM1L1Q8N609 369 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4K2Q8NGD2 314 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGR4Q9BXB1 951 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA16Q9BXB7 569 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL21RQ9HBE5 538 aa32.94■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 KELP23276 732 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 RXRGP48443 463 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP8P85298 464 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPT6Q14141 434 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa32.93■■■□□ 2.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CERCAMQ5T4B2 595 aa32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms