RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNF165P49910 485 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ACTR1AP61163 376 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PTSQ03393 145 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KCNC4Q03721 635 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 DPTQ07507 201 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TRAF2Q12933 501 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SQSTM1Q13501 440 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NR1I3Q14994 352 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NR1D2Q14995 579 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NFKBIBQ15653 356 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LINC00303Q3SY05 128 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NLRP8Q86W28 1048 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 DTX1Q86Y01 620 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 EXD3Q8N9H8 876 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KCTD6Q8NC69 237 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 EXD1Q8NHP7 514 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 AP2M1Q96CW1 435 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SEMA3CQ99985 751 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CDH19Q9H159 772 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NT5MQ9NPB1 228 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CD84Q9UIB8 345 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.13□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 STMND1H3BQB6 276 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MATN3O15232 486 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PPM1DO15297 605 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SERPING1P05155 500 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PDHA1P08559 390 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNF30P17039 623 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CA4P22748 312 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LHCGRP22888 699 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 IL4RP24394 825 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ATP1A2P50993 1020 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LIMK2P53671 638 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NFATC3Q12968 1075 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LRP8Q14114 963 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PTPRRQ15256 657 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PYCR3Q53H96 274 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 FIGNQ5HY92 759 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 LRRC66Q68CR7 880 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 DOK6Q6PKX4 331 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 VASH2Q86V25 355 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NAGSQ8N159 534 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 TEX26Q8N6G2 289 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 EXTL1Q92935 676 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SCAMP4Q969E2 229 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 OR2M4Q96R27 311 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC38A3Q99624 504 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 NUP85Q9BW27 656 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 THAP2Q9H0W7 228 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ABCG8Q9H221 673 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 CLMPQ9H6B4 373 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 AMACRQ9UHK6 382 aa8.12□□□□□ -1.11
COCH-211ENST00000557065 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.12□□□□□ -1.11
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