RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RASA4B	C9J798	803 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RASA4	O43374	803 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	AGFG2	O95081	481 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DNA2	P51530	1060 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RWDD2B	P57060	319 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HID1	Q8IV36	788 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MPST	P25325	297 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SERPINB6	P35237	376 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NEK3	P51956	506 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	THOP1	P52888	689 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	COPS2	P61201	443 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SGCG	Q13326	291 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	GLMN	Q92990	594 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	KDELR3	O43731	214 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MFSD11	O43934	449 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MMP20	O60882	483 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PRNP	P04156	253 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PYGM	P11217	842 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PTPN7	P35236	360 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ARF5	P84085	180 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	PPARD	Q03181	441 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	DFFA	O00273	331 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	APOL1	O14791	398 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	B4GAT1	O43505	415 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	CD160	O95971	181 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	UGT1A3	P35503	534 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	CD97	P48960	835 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	GBE1	Q04446	702 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-231	ENST00000552222	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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