RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 AK5Q9Y6K8 562 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 RP1P56715 2156 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 PJA2O43164 708 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 MTSS1O43312 755 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CSO75390 466 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 TCEA3O75764 348 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 IVLP07476 585 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CDC25BP30305 580 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SPINT3P49223 89 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 VAV2P52735 878 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 COPS2P61201 443 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ADCY2Q08462 1091 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 GALNT3Q14435 633 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SCAMP4Q969E2 229 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 TEKT5Q96M29 485 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 TRIB3Q96RU7 358 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SUFUQ9UMX1 484 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 HACD1B0YJ81 288 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 FUCA1P04066 466 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 GNPDA1P46926 289 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CDK18Q07002 472 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 BBS12Q6ZW61 710 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM139Q8IV31 216 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 COX14Q96I36 57 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 HIC2Q96JB3 615 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 AGAP2Q99490 1192 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 RAXQ9Y2V3 346 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC66A2RUB6 948 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 NOBOXO60393 691 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 APOC2P02655 101 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 CTNNA2P26232 953 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 WASHC5Q12768 1159 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 PCSK7Q16549 785 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ISXQ2M1V0 245 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA1328Q86T90 577 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 HAUS1Q96CS2 278 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 WDR24Q96S15 920 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 VAT1Q99536 393 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.83■□□□□ 0.29
HOXD8-204ENST00000544999 B4DGG1 531 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 BRINP1O60477 761 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 USP12O75317 370 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 NDST3O95803 873 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 PNLIPP16233 465 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 GLB1P16278 677 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 PTPN7P35236 360 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 POLD2P49005 469 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 XRCC4Q13426 336 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 PEX6Q13608 980 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 SPIDRQ14159 915 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 DOK6Q6PKX4 331 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 NRROSQ86YC3 692 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 TXLNBQ8N3L3 684 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
HOXD8-204ENST00000544999 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms