RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FBP2O00757 339 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PGRMC2O15173 223 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MATN4O95460 622 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ALDH1A1P00352 501 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MMP3P08254 477 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CHRNB2P17787 502 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TXKP42681 527 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNJ5P48544 419 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SEPHS1P49903 392 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PRAMEP78395 509 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ITGA7Q13683 1181 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LLGL2Q6P1M3 1020 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TTLL6Q8N841 843 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 C1orf216Q8TAB5 229 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 TXNDC15Q96J42 360 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 C3orf30Q96M34 536 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK15Q96Q40 435 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RUSC1Q9BVN2 902 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RGCCQ9H4X1 137 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PP2D1A8MPX8 630 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 SLC16A5O15375 505 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 XPNPEP2O43895 674 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 AP2A2O94973 939 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NR3C1P04150 777 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 Q3C1V9 767 aa3.15□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.916e-7■■□□□ 12.6
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JMJD1C-210ENST00000542921 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFA6Q01524 100 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TLE2Q04725 743 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PPATQ06203 517 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 USP4Q13107 963 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PAK1Q13153 545 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MTMR2Q13614 643 aa3.15□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RAPSNQ13702 412 aa3.15□□□□□ -1.91
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