RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	AP3D1	O14617	1153 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TBX18	O95935	607 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PCCB	P05166	539 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	JAK1	P23458	1154 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SLC7A2	P52569	658 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ERVK-21	P61565	698 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606		U3KQV3	271 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ALOX12	P18054	663 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ACLY	P53396	1101 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	COX10	Q12887	443 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	NFKBIE	O00221	500 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SLC28A2	O43868	658 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MED26	O95402	600 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PSMG1	O95456	288 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RAB14	P61106	215 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CYP4F8	P98187	520 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	GMFG	O60234	142 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	FSBP	O95073	299 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PTPN2	P17706	415 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	GABRB2	P47870	512 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CDC42	P60953	191 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	NELL1	Q92832	810 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CENPX	A8MT69	81 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ATG13	O75143	517 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	NOL4	O94818	638 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PRG2	P13727	222 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF24	P17028	368 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MPST	P25325	297 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	MPP1	Q00013	466 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	STX11	O75558	287 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PRNP	P04156	253 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SLC6A2	P23975	617 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	KCNJ2	P63252	427 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RHAG	Q02094	409 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SNX27	Q96L92	541 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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