RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SUFUQ9UMX1 484 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 AGRPO00253 132 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 INPP4BO15327 924 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ZW10O43264 779 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TNFSF15O95150 251 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FUCA1P04066 466 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PYGLP06737 847 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 COMTP21964 271 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ALDH4A1P30038 563 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 DYNLT1P63172 113 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 DPTQ07507 201 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PEX6Q13608 980 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PDK1Q15118 436 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 LLGL1Q15334 1064 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SPA17Q15506 151 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 BROXQ5VW32 411 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NPNTQ6UXI9 565 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CCNJLQ8IV13 435 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PLD5Q8N7P1 536 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 EXD1Q8NHP7 514 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FATE1Q969F0 183 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 AGAP3Q96P47 875 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 STRADBQ9C0K7 418 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 INTUQ9ULD6 942 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PQM1 296 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CAPN8A6NHC0 703 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 KLK10O43240 276 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NOBOXO60393 691 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 MTA2O94776 668 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PRLP01236 227 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FGF1P05230 155 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PNLIPP16233 465 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PDX1P52945 283 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 INHBCP55103 352 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CXADRP78310 365 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SKOR1P84550 965 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CTBSQ01459 385 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TLE3Q04726 772 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB17Q13105 803 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 GALNT3Q14435 633 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 IHHQ14623 411 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 PCSK7Q16549 785 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 AMZ1Q400G9 498 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 LRRC38Q5VT99 294 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 KAZNQ674X7 775 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 NLRP8Q86W28 1048 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 VSIG1Q86XK7 387 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 JAMLQ86YT9 394 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-222ENST00000540445 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms