RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537951.1

NPIPB4-208, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-208	ENST00000537951	ELK3	P41970	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	DCDC1	P59894	354 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	VSNL1	P62760	191 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	DPT	Q07507	201 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	STEAP4	Q687X5	459 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NLRP8	Q86W28	1048 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SPACA7	Q96KW9	195 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TBATA	Q96M53	351 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FZD3	Q9NPG1	666 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	GPR27	Q9NS67	375 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PLXNA2	O75051	1894 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	POM121B	A6NF01	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	AGAP14	A8MT82	685 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951		H0Y8X5	98 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SLC4A1	P02730	911 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ITPKA	P23677	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TRIM23	P36406	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ARL4C	P56559	192 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CLDN2	P57739	230 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	BNC1	Q01954	994 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CAV1	Q03135	178 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CUL1	Q13616	776 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ARHGEF7	Q14155	803 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ACOX1	Q15067	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	IRF4	Q15306	451 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	HIF1A	Q16665	826 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	BBS9	Q3SYG4	887 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ARMC3	Q5W041	872 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	KCTD16	Q68DU8	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	C2orf81	A6NN90	581 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	AP3B1	O00203	1094 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	NDUFS2	O75306	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CRTAM	O95727	393 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CD27	P26842	260 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TEAD1	P28347	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	FOXN2	P32314	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	GPX6	P59796	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PFN3	P60673	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SEPT6	Q14141	434 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	SEMA3A	Q14563	771 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	CHRNA6	Q15825	494 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-208	ENST00000537951	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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