RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CEP72	Q9P209	647 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	FRYL	O94915	3013 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF292	O60281	2723 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CIT	O14578	2027 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478		H7C4K7	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF197	O14709	1029 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PPEF2	O14830	753 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF263	O14978	683 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SYN3	O14994	580 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MTSS1	O43312	755 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	DNPH1	O43598	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	VNN2	O95498	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	VIP	P01282	170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CD1A	P06126	327 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CXCL8	P10145	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	NR2F1	P10589	423 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MCF2	P10911	925 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CHRNB1	P11230	501 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TDGF1	P13385	188 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	JUP	P14923	745 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	KCNE1	P15382	129 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PRKCA	P17252	672 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PFKL	P17858	780 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PSMC3	P17980	439 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PROZ	P22891	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CCNE1	P24864	410 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TNFSF9	P41273	254 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SLC6A9	P48067	706 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF131	P52739	623 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	OXCT1	P55809	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	WNT3A	P56704	352 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	VSNL1	P62760	191 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	GNGT1	P63211	74 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CYP4F8	P98187	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CREB5	Q02930	508 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	REST	Q13127	1097 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	XRCC4	Q13426	336 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478		Q6ZS52	159 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	MAML1	Q92585	1016 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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