RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX6Q13608 980 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 19
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF284Q2VY69 593 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 STEAP4Q687X5 459 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 HORMAD1Q86X24 394 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 CAVIN3Q969G5 261 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RIPK2O43353 540 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 TM7SF2O76062 418 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 FSBPO95073 299 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAMEP78395 509 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 XIAPP98170 497 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNA6Q15825 494 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 FBF1Q8TES7 1133 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 NAT9Q9BTE0 207 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 EBF2Q9HAK2 575 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PREBQ9HCU5 417 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC72A6NJI9 287 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD51BO15315 384 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 MC4RP32245 332 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 HSD17B3P37058 310 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC29A2Q14542 456 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 NAT14Q8WUY8 206 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 DTD2Q96FN9 168 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE1BQ01064 536 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 ACVR1Q04771 509 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 NUS1Q96E22 293 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-208ENST00000524325 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 PRAMEF1O95521 474 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 OXTRP30559 389 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAM1P38567 509 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SGCGQ13326 291 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMB3Q13751 1172 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 LONRF1Q17RB8 773 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP9Q49MG5 647 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNJLQ8IV13 435 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 AP2M1Q96CW1 435 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 ERLIN1O75477 346 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SHBGP04278 402 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 PCCBP05166 539 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV4-34P06331 123 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA3AQ14563 771 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNMB4Q86W47 210 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX19Q92543 992 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 BIRC7Q96CA5 298 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 CERS2Q96G23 380 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD11O00231 422 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFS2O75306 463 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 HADHAP40939 763 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.63■■□□□ 1.21
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