RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517514.1

CLN8-202, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 4

Gene CLN8, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-202ENST00000517514 OR51F1A6NGY5 319 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 H0Y8X5 98 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 H7C0S8 307 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 MAP3K13O43283 966 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CRTAMO95727 393 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 FAM153BP0C7A2 387 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PRSS56P0CW18 603 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ITPKAP23677 461 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ELK3P41970 407 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 SEPT6Q14141 434 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 BBS9Q3SYG4 887 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 FAM153CQ494X1 144 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 STEAP4Q687X5 459 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 STYXQ8WUJ0 223 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 IFT81Q8WYA0 676 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 NUS1Q96E22 293 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 TBATAQ96M53 351 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 SLC6A18Q96N87 628 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 GPR27Q9NS67 375 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 HEATR9A2RTY3 570 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.84□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 AP3B1O00203 1094 aa9.84□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 UGT1A1P22309 533 aa9.84□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 CD27P26842 260 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 TNFRSF8P28908 595 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 FOXN2P32314 431 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 UGT1A3P35503 534 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 UGT1A5P35504 534 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 TRIM23P36406 574 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ARL4CP56559 192 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 GPX6P59796 221 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 VSNL1P62760 191 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CAV1Q03135 178 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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CLN8-202ENST00000517514 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 SEMA3AQ14563 771 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 LRRC14Q15048 493 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 CHRNA6Q15825 494 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 LPAL2Q16609 132 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ALS2CLQ60I27 953 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 KCTD16Q68DU8 428 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PNCKQ6P2M8 343 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 LAYNQ6UX15 382 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 C11orf74Q86VG3 221 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 IFT20Q8IY31 132 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-202ENST00000517514 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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