RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 SECTM1Q8WVN6 248 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 RFFLQ8WZ73 363 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ST8SIA4Q92187 359 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SGCDQ92629 289 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 CD101Q93033 1021 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 PIGTQ969N2 578 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 TAAR8Q969N4 342 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SAAL1Q96ER3 474 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 C3orf30Q96M34 536 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCLT1Q96NL6 688 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 BBS4Q96RK4 519 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 NODALQ96S42 347 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SIN3AQ96ST3 1273 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 KXD1Q9BQD3 176 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SYT17Q9BSW7 474 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 RAB6CQ9H0N0 254 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SIL1Q9H173 461 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC32A1Q9H598 525 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 RETREG1Q9H6L5 497 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 JMJD4Q9H9V9 463 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SDF2L1Q9HCN8 221 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 BPIFA1Q9NP55 256 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZFP57Q9NU63 452 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 GGA3Q9NZ52 723 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC9A2Q9UBY0 812 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 HAO1Q9UJM8 370 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 POU2F3Q9UKI9 436 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 RCOR1Q9UKL0 485 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SARDHQ9UL12 918 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ERVK-11Q9UQG0 969 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF711Q9Y462 761 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 SNX9Q9Y5X1 595 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 CEPT1Q9Y6K0 416 aa0.84□□□□□ -2.27
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTPRCP08575 1304 aa0.84□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 AGRNO00468 2067 aa0.84□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 A0A1W2PP11 408 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 A0A1W2PQF6 199 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM90A26D6RGX4 464 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 F5H0A9 414 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 DVL1O14640 695 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCAMP1O15126 338 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 KCNN4O15554 427 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNHIT1O43257 154 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPINT2O43291 252 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 HCRTR2O43614 444 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 SYNGR3O43761 229 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCDH7O60245 1069 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 FGF17O60258 216 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 WDR1O75083 606 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 JRKO75564 520 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEC14L2O76054 403 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDE9AO76083 593 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDX58O95786 925 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGHV4-39P01824 125 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 CRYAAP02489 173 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 AFPP02771 609 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 POLBP06746 335 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 INHBAP08476 426 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDH1P12830 882 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 XBP1P17861 261 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 MARK3P27448 753 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 BDKRB2P30411 391 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 ELF1P32519 619 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 BSGP35613 385 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDIT3P35638 169 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 DCTP40126 519 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 IL15P40933 162 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMPOP42166 694 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 NR2C2P49116 596 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 GNAQP50148 359 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 TERF1P54274 439 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 NLRP5P59047 1200 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 PHEXP78562 749 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPL24P83731 157 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms