RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFS1Q9Y697 457 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 hDV102S1A0JD36 115 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf226A1L170 272 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC01553A4QN01 128 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTBD18B2RXH4 712 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROB1E7EW31 1015 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOCS6O14544 535 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 VCYO14598 125 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 VILLO15195 856 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC28A2O43868 658 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCGR1AP12314 374 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 RRM1P23921 792 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACADLP28330 430 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDH8P55286 799 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DSCR9P59020 149 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBA1BP68363 451 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TFAP4Q01664 338 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRF3Q14653 427 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAB2Q15742 525 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DECR1Q16698 335 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCN10Q6JVE6 187 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFAP77Q6ZQR2 320 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHST9Q7L1S5 443 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 FJX1Q86VR8 437 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 BEST3Q8N1M1 668 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 NEUROG1Q92886 237 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 EGLN2Q96KS0 407 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIGD1Q96MW7 591 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 KXD1Q9BQD3 176 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAREM1Q9H706 876 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYNCQ9H7C4 482 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 AP3D1O14617 1153 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 RFPL2O75678 378 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GFPT2O94808 682 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLDN14O95500 239 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R3DO95685 299 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM11P17152 192 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALOX12P18054 663 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GABRB1P18505 474 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 UGT1A1P22309 533 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFRSF8P28908 595 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 BDKRB2P30411 391 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCKARP32238 428 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDLIM4P50479 330 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAS2R40P59535 323 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZXDBP98169 803 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CREB5Q02930 508 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLG1Q12959 904 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYBPHQ13203 477 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKG2Q13237 762 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACVR2BQ13705 512 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 KEAP1Q14145 624 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 HLFQ16534 295 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 XKR9Q5GH70 373 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRG2Q64ET8 278 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 GLCCI1Q86VQ1 547 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRROSQ86YC3 692 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 DSELQ8IZU8 1212 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms