RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM14Q96QK8 99 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSTPIP1O43586 416 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLDN7O95471 211 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDKN2BP42772 138 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFDP2Q14188 446 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 QPCTQ16769 361 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRROSQ86YC3 692 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIC2Q96JB3 615 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD84Q9UIB8 345 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUFUQ9UMX1 484 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SATB2Q9UPW6 733 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQM1 296 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGF1P05230 155 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNT1P13805 278 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNPDA1P46926 289 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL7P80098 99 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPA17Q15506 151 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC14A2Q15849 920 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX44Q53QW1 395 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPNTQ6UXI9 565 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COX14Q96I36 57 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PANX2Q96RD6 677 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THSD1Q9NS62 852 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACNA1GO43497 2377 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITPKBP27987 946 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADCY8P40145 1251 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLD2P49005 469 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPINT3P49223 89 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDX1P52945 283 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYNLT1P63172 113 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTBSQ01459 385 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNJLQ8IV13 435 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TADA1Q96BN2 335 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM74Q96NL1 305 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGAP3Q96P47 875 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIB3Q96RU7 358 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR24Q96S15 920 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGAP2Q99490 1192 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDH19Q9H159 772 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B4DGG1 531 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 D6RAR5 112 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZW10O43264 779 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTSS1O43312 755 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CST8O60676 142 aa16.73■□□□□ 0.27
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