RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 OR4C6Q8NH72 309 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ARRDC2Q8TBH0 407 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HDAC8Q9BY41 377 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 WHRNQ9P202 907 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SNX24Q9Y343 169 aa11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 A6NNZ2 444 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 AP3B1O00203 1094 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MUSKO15146 869 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PIAS2O75928 621 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MT-CO3P00414 261 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TUBBP07437 444 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ALPPL2P10696 532 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MCM3P25205 808 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IVDP26440 423 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CD86P42081 329 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RGRP47804 291 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 E2F1Q01094 437 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 BCL2L1Q07817 233 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZSR6 202 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00523Q86TU6 105 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HOOK3Q86VS8 718 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PAF1Q8N7H5 531 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 EXOC2Q96KP1 924 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DPH5Q9H2P9 285 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NOD2Q9HC29 1040 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 WDR70Q9NW82 654 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 APC2O95996 2303 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KNL1Q8NG31 2342 aa11.36□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PQ67 120 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 F5H423 210 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 BRINP1O60477 761 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PMPCBO75439 489 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 AP2A1O95782 977 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 EPOP01588 193 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 APRTP07741 180 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MYF5P13349 255 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ADRB3P13945 408 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TPSB2P20231 275 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ITGB7P26010 798 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINA4P29622 427 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA6P43360 314 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SKOR1P84550 965 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CUL1Q13616 776 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MORF4L2Q15014 288 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TPSAB1Q15661 275 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FAXCQ5TGI0 409 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SEC14L1Q92503 715 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CPT1BQ92523 772 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FGF11Q92914 225 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IFT43Q96FT9 208 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FEM1CQ96JP0 617 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 APOLD1Q96LR9 279 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 UBP1Q9NZI7 540 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa11.35□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ITPR1Q14643 2758 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms