RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1B0GTQ1 180 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR1P46091 355 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 APOL2Q9BQE5 337 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMA1P25391 3075 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 C4orf47A7E2U8 309 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 H3BM21 787 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TPSB2P20231 275 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 BLKP51451 505 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB2AQ13885 445 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SPARCL1Q14515 664 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R7Q15435 360 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TPSAB1Q15661 275 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 INAVAQ3KP66 663 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAAF3Q8N9W5 541 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX101Q9BY14 249 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TM7SF3Q9NS93 570 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM131Q92545 1883 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFRSF10CO14798 259 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA12O60330 932 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 GDF9O60383 454 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 USP12O75317 370 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 GPS1Q13098 491 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 FZD2Q14332 565 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 EID2BQ96D98 161 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TBATAQ96M53 351 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR92Q96MX6 357 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 IL17CQ9P0M4 197 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 CD84Q9UIB8 345 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1A2Q9Y585 309 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0U1RQS6 177 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC30A4O14863 429 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 STX7O15400 261 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC4A1P02730 911 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEA6P43360 314 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 PRUNE1Q86TP1 453 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAM1L1Q8N609 369 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 SCAMP4Q969E2 229 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 NEU2Q9Y3R4 380 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-212ENST00000508338 AURKAO14965 403 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 CSF2P04141 144 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 NME1P15531 152 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 SPAM1P38567 509 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 HADHAP40939 763 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK3Q00526 305 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 ARMC3Q5W041 872 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 RTKNQ9BST9 563 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 CASS4Q9NQ75 786 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 SCN8AQ9UQD0 1980 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 BPIP17213 487 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 PPARDQ03181 441 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 OLIG2Q13516 323 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 RFLNAQ6ZTI6 216 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 PCGF5Q86SE9 256 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 OR56A4Q8NGH8 313 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 HIC2Q96JB3 615 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJC28Q9NX36 388 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 KLQ9UEF7 1012 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 APPL1Q9UKG1 709 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 K7ESM1 405 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 FLRT2O43155 660 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 DR1Q01658 176 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGA9Q13797 1035 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 PTK6Q13882 451 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 ENPP7Q6UWV6 458 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR26Q8NDV2 337 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52K1Q8NGK4 314 aa26.68■■□□□ 1.86
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