RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 DSC2Q02487 901 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PPARDQ03181 441 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ELP6Q0PNE2 266 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ILKQ13418 452 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT81Q14533 505 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MESDQ14696 234 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 RTP5Q14D33 572 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CNGA3Q16281 694 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 DPPA4Q7L190 304 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 LZTR1Q8N653 840 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TEX26Q8N6G2 289 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TEKT4Q8WW24 435 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 BOCQ9BWV1 1114 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SPASTQ9UBP0 616 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SEPT3Q9UH03 358 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TFR2Q9UP52 801 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 C9orf172C9J069 976 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 USP12O75317 370 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CSO75390 466 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PROSCO94903 275 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PRLP01236 227 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TNFP01375 233 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ANXA6P08133 673 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 H2AFZP0C0S5 128 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ALPPL2P10696 532 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 KDELR1P24390 212 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINA4P29622 427 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 HNF1BP35680 557 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ETV3P41162 512 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MMP13P45452 471 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PEX5P50542 639 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 HK3P52790 923 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CCL7P80098 99 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 GBE1Q04446 702 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ITKQ08881 620 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PTK2BQ14289 1009 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NFATC4Q14934 902 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ACOX1Q15067 660 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 LLGL1Q15334 1064 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC18A3Q16572 532 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CFAP58Q5T655 872 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MARC1Q5VT66 337 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ERAP2Q6P179 960 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PNCKQ6P2M8 343 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NPNTQ6UXI9 565 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MACC1Q6ZN28 852 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 Q6ZVL8 140 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 H2AFVQ71UI9 128 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 VSTM4Q8IW00 320 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 KCTD6Q8NC69 237 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPK15Q8TD08 544 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PDXPQ96GD0 296 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 COQ10AQ96MF6 247 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF599Q96NL3 588 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 AGAP2Q99490 1192 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 IL12RB2Q99665 862 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SEMA3CQ99985 751 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MGME1Q9BQP7 344 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 FGF22Q9HCT0 170 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CD84Q9UIB8 345 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 PADI4Q9UM07 663 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF4B-208ENST00000490653 CHKBQ9Y259 395 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms