RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 MIB2Q96AX9 1013 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TXNDC15Q96J42 360 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 EGLN2Q96KS0 407 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ACOX2Q99424 681 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ZPBPQ9BS86 351 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 FBXL17Q9UF56 701 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PADI3Q9ULW8 664 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CLIC4Q9Y696 253 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TAF1P21675 1872 aa3.3□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQ09 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PR77 199 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CPED1A4D0V7 1026 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SOCS6O14544 535 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ATP2A1O14983 1001 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 NDUFB4O95168 129 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CH25HO95992 272 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 IGKV3-20P01619 116 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CLTBP09497 229 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ZNF12P17014 697 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 AMTP48728 403 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PCYT1AP49585 367 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 DDR1Q08345 913 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ST3GAL1Q11201 340 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PMS2CLQ68D20 193 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 JADE1Q6IE81 842 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 AACSQ86V21 672 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 OR2A14Q96R47 310 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 GAD1Q99259 594 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MXD3Q9BW11 206 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 NDST4Q9H3R1 872 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PIGMQ9H3S5 423 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PLK3Q9H4B4 646 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 KAT14Q9H8E8 782 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 hDV102S1A0JD36 115 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 OR6C75A6NL08 312 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 VWA5AO00534 786 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 WNT9BO14905 357 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TGFB3P10600 412 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ACADLP28330 430 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 CDC25AP30304 524 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PRKG2Q13237 762 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 WDR73Q6P4I2 378 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 BEST3Q8N1M1 668 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PGBD5Q8N414 524 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TMED6Q8WW62 240 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TMEM68Q96MH6 324 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 COPG2Q9UBF2 871 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MYO6Q9UM54 1294 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 NENFQ9UMX5 172 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.28□□□□□ -1.88
SENP6-208ENST00000483859 TTC36A6NLP5 189 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ASAP2O43150 1006 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HCRTR2O43614 444 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ENTPD3O75355 529 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms