RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 L1CAMP32004 1257 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GMPRP36959 345 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GPX6P59796 221 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DEUP1Q05D60 604 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PDK1Q15118 436 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KIF19Q2TAC6 998 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ALFQ53S48 1182 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 LINGO4Q6UY18 593 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BNIPLQ7Z465 357 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NAXDQ8IW45 347 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FBF1Q8TES7 1133 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCT6BQ92526 530 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KLK6Q92876 244 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NT5C3BQ969T7 300 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MTBPQ96DY7 904 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC6A18Q96N87 628 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NPY6RQ99463 290 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PAFAH2Q99487 392 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NAT9Q9BTE0 207 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MUC3BQ9H195 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 WDCPQ9H6R7 721 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 VPS28Q9UK41 221 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SARDHQ9UL12 918 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FZD10Q9ULW2 581 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS20P59510 1910 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GVM2 712 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CFAP73A6NFT4 308 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TTLL8A6PVC2 850 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 K7ERQ8 282 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 AP3B1O00203 1094 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RNF103O00237 685 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TYROBPO43914 113 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ATP5HO75947 161 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MT-CO1P00395 513 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MT-ND3P03897 115 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 WNT1P04628 370 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RHOCP08134 193 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC2A3P11169 496 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MX2P20592 715 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CA4P22748 312 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CNTFP26441 200 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RBL1P28749 1068 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ALDH3A1P30838 453 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HCAR3P49019 387 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CXCR3P49682 368 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SERPINB9P50453 376 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PPP2CBP62714 309 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PPP2CAP67775 309 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SCAPQ12770 1279 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DNAJC3Q13217 504 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NAB1Q13506 487 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SEMA5AQ13591 1074 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DLG2Q15700 870 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PDK4Q16654 411 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HHATQ5VTY9 493 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NPNTQ6UXI9 565 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SPATA21Q7Z572 469 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM131BQ86XD5 332 aa6.29□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.29□□□□□ -1.4
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