RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 WDFY2Q96P53 400 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 STRA6Q9BX79 667 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PQF6 199 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RRM1P23921 792 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 DLX5P56178 289 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 POU5F1BQ06416 359 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 DPPA4Q7L190 304 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 NAGSQ8N159 534 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PAF1Q8N7H5 531 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 BBS10Q8TAM1 723 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 EVI5LQ96CN4 794 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ACOX2Q99424 681 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 EBF2Q9HAK2 575 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 C1orf226A1L170 272 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 B4E171 279 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CLEC3BP05452 202 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 S1PR1P21453 382 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TSPAN7P41732 249 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 FUT6P51993 359 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ZNF132P52740 706 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KRT24Q2M2I5 525 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CDONQ4KMG0 1287 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 BEST3Q8N1M1 668 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 UCMAQ8WVF2 138 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PADI1Q9ULC6 663 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MBD4O95243 580 aa6.68□□□□□ -1.34
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SGCE-210ENST00000472326 PAX3P23760 479 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 BSGP35613 385 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CLCN3P51790 818 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MED22Q15528 200 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 GFRALQ6UXV0 394 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CUZD1Q86UP6 607 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TMEM219Q86XT9 240 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CD101Q93033 1021 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TMEM68Q96MH6 324 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TTC14Q96N46 770 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MAP7D2Q96T17 732 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 AASSQ9UDR5 926 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 NOTCH4Q99466 2003 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 DOCK7Q96N67 2140 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PRG0 241 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CAMTA2O94983 1202 aa6.67□□□□□ -1.34
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SGCE-210ENST00000472326 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TTI2Q6NXR4 508 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 FRMD1Q8N878 549 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 C7orf26Q96N11 449 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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