RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 RASSF2P50749 326 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SUOXP51687 545 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZXDAP98168 799 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SREBF2Q12772 1141 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MTX1Q13505 466 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ALCAMQ13740 583 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 LAMB3Q13751 1172 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SCARB2Q14108 478 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MMEL1Q495T6 779 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CRY2Q49AN0 593 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 IGSF11Q5DX21 431 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 Q5PR19 223 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM198Q66K66 360 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PARM1Q6UWI2 310 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PALB2Q86YC2 1186 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 EGLN2Q96KS0 407 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZWILCHQ9H900 591 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM10O14672 748 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT9BO14905 357 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CYC1P08574 325 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC175P0C221 793 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GNLYP22749 145 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 THPOP40225 353 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ARSEP51690 589 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SELENOVP59797 346 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TMF1P82094 1093 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TFCP2Q12800 502 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 IL11RAQ14626 422 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CHST3Q7LGC8 479 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TRMOQ9BU70 441 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PIGMQ9H3S5 423 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MRGBPQ9NV56 204 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM51Q9NW97 253 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 AMACRQ9UHK6 382 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 COG5Q9UP83 839 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 COX11Q9Y6N1 276 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 LDB2O43679 373 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT3O95989 172 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ICAM1P05362 532 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PRLRP16471 622 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MSH2P43246 934 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP14P50281 582 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 TGFB2P61812 414 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 DLG2Q15700 870 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF284Q2VY69 593 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 C10orf25Q5T742 122 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 DLK2Q6UY11 383 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.67□□□□□ -1.66
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