RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF358Q9NW07 568 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DKK3Q9UBP4 350 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IL36AQ9UHA7 158 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TLK1Q9UKI8 766 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HCN2Q9UL51 889 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PKP3Q9Y446 797 aa9.52□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PPC1 479 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ERICH4A6NGS2 130 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ANHXE9PGG2 379 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 KLF11O14901 512 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 LEFTY1O75610 366 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IL1BP01584 269 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 C1SP09871 688 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TIMP2P16035 220 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BPIP17213 487 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BGNP21810 368 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RGS19P49795 217 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SUOXP51687 545 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CACNG1Q06432 222 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DLG1Q12959 904 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HTR4Q13639 388 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF460Q14592 562 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PCLAFQ15004 111 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZSCAN26Q16670 478 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC153Q494R4 210 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CES4AQ5XG92 561 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC66Q68CR7 880 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 RAPH1Q70E73 1250 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MTSS1LQ765P7 747 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PAF1Q8N7H5 531 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF366Q8N895 744 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 GPR78Q96P69 363 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM245Q9H330 911 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ACOT9Q9Y305 439 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 VWA7Q9Y334 891 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.51□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TARM1B6A8C7 271 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 G3V2L1 256 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SNX3O60493 162 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFS3O75489 264 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL2O95198 593 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 KAT7O95251 611 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SBK3P0C264 359 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 HLA-EP13747 358 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PMLP29590 882 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ALDH3A1P30838 453 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 CA5AP35218 305 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SPAM1P38567 509 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SLC26A3P40879 764 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TTPAP49638 278 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PTPN5P54829 565 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SLC12A2P55011 1212 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 IRX4P78413 519 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 SEMG2Q02383 582 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 PTSQ03393 145 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 DMTNQ08495 405 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF234Q14588 700 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms